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ANT1: 一夫当关,万夫莫开!

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按:老基因,新功能。发育调控的主开关基因,但感觉研究还不是很深入,还有很多故事可以挖!拟南芥AINTEGUMENTA基因(AtANT)是一个 APETALA

按:老基因,新功能。发育调控的主开关基因,但感觉研究还不是很深入,还有很多故事可以挖!

拟南芥AINTEGUMENTA基因(AtANT)是一个 APETALA 2 (AP2) 转录因子家族基因,之前研究显示该基因参与胚珠发育和花器官发育,具体来说参与器官原基起始,雌配子体形成以及器官的生长和极性建成。

近期,台湾中央研究院生物多样性研究中心,美国芝加哥大学的Wen-Hsiung Li(李文雄)院士团队在PNAS发表题为“Maize ANT1 modulates vascular development, chloroplast development, photosynthesis, and plant growth”的研究论文,发现玉米中的ANT1可以通过调控下游重要基因直接参与细胞增殖,叶片生长,维管和维管束的发育,叶绿体发育以及光合作用等重要的发育和生理过程。

首先共表达分析发现,玉米的4个ANT同源基因(ZmANT1-4),仅有ZmANT1与一个C4植物花环结构( Kranz anatomy)形成的关键调控基因 SCARECROW1(ZmSCR1)在玉米胚叶发育过程中共表达(图1A)。DNA affinity purification and sequencing(DAP-seq) 和EMSA检测发现,ZmANT1可以结合到ZmSCR1启动子区的特异区段,调控其表达(图1B-D)。

图1 玉米ANT1与SCR1启动子的结合检测

RNA原位杂交分析显示,ANT1在发育中的叶原基中表达(图2)。

图2 RNA原位杂交检测ANT1表达

为了进一步验证ANT1基因的功能,利用CRISPR-CAS9基因编辑技术,研究者在青狗尾草(Setaria viridis)中编辑了ANT1同源基因SvANT1(青狗尾草由于基因组小、高效转化、生育期短,且易于实验室培养操作,已发展成为禾本科黍亚科和C4光合作用的模式植物)(图3)。

图3 Svant1基因编辑检测

仔细观察两个移码突变的编辑株系Svant1-2和-3发现,ANT1基因的缺失会使突变体生长变慢,叶片和穗状花序变小小,产量降低(图4)。

图3 Svant1突变体表型检测

由于ANT1可以直接调控SCR1的表达,所以研究者还比较了突变体和野生型维管的形态,结果显示突变体中维管形态异常,叶脉不能正常形成(图5)。

图5 5周的WT和SvANT1突变材料的叶片维管表型检测

之后,通过表达分析发现,大量差异表达基因参与光合作用和叶绿体发育(图6A-F),突变体中净光合速率值(Pn)显著低于野生型(图6G)。进一步实验证实,ANT1可以直接结合光合作用,叶绿体和植物发育关键调控基因的启动子(如SvSCR1,SvGNC, SvAN3等,图7),直接影响这些基因的表达。

图6 DEG,功能富集分析及突变体中光合作用的降低检测
图7 ANT1调控模型

总的来说,结合本文及之前的研究,我们可以知道,ANT1是一个主开关(master switch),调控着花器官建成,叶片维管发育,叶绿体形成,光合作用,植物生长,最终影响谷物的产量

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